Lo primero, tener el programa: VirtualDubMOD

Pues abrimos el programa y cargamos el archivo que queremos convertir dando a File->Open Video File
Luego vamos a Streams->Stream list y nos aparecerá una ventana como ésta:



Aquí añadiremos o quitaremos los audios y subtítulos que deseemos pulsando en “Add” o “Delete” respectivamente.

Nota: Aunque en la imagen se puede observar un audio MP3 (el de la película origial), es recomendable no utilizar audios diferentes del OGG en archivos OGM, pues suelen dar problemas.

Si pulsamos en “Comments” teniendo seleccionada una de las cadenas (un audio o un subtítulo) podremos configurar sus comentarios tales como autor, título, lenguaje…



Para cada comentario tendremos que pulsar en “Add” para añadirlo a la cadena.

Una vez configurados todos los comentarios, volvemos a la pantalla principal de VirtualDubMOD pulsando en “Ok” para que todo quede guardado.

Aquí tendremos también configuraremos los comentarios del video de la misma manera pulsando en Streams->Video comments

Ya tenemos configurados los comentarios, ahora vamos a crear los capítulos. Vamos a Streams->Video chapters y nos aprecerá esta pantalla:



Aquí añadiremos el título y el tiempo de los capítulos.
Si pulsamos en “Import” podemos cargar un archivo de texto con los capítulos. Este archivo de texto puede ser creado por rippeadores como el DVD Decrypter.

Finalmente marcamos la opción Video->Direct stream copy
y guardamos el archivo pulsando en File->Save As… y asegurándonos que el tipo de archivo que elegimos es el .ogm

[Fuente]